Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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SAMD8Q96LT4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD8Q96LT4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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