Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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