Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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USP47Q96K76 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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USP47Q96K76 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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USP47Q96K76 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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