Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ1Q96JM4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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