Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms