Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTHRC1Q96CG8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTHRC1Q96CG8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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