Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ULK4Q96C45 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms