Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNF34Q969K3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms