Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCE1Q969G3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms