Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms