Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms