Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLHC1Q8NHS4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms