Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATL2Q8NHH9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms