Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC117Q8IWD4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms