Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CATSPER4Q7RTX7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CATSPER4Q7RTX7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms