Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms