Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL17Q6TDP4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms