Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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