Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms