Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms