Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPPQ6IPU0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPPQ6IPU0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms