Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0K9

HBM, Hemoglobin subunit mu, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBMQ6B0K9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HBMQ6B0K9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms