Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms