Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms