Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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