Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PERM1Q5SV97 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms