Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN2Q52LD8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms