Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms