Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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CCDC142Q17RM4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCDC142Q17RM4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCDC142Q17RM4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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