Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms