Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PTPRNQ16849 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRNQ16849 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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