Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2B3Q16720 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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