Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms