Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS72Q15906 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS72Q15906 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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