Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms