Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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