Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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