Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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