Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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