Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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