Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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