Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IHHQ14623 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IHHQ14623 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IHHQ14623 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IHHQ14623 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IHHQ14623 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IHHQ14623 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IHHQ14623 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IHHQ14623 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IHHQ14623 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms