Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms