Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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