Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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