Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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