Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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