Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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PEX6Q13608 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PEX6Q13608 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PEX6Q13608 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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PEX6Q13608 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PEX6Q13608 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PEX6Q13608 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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