Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SP140Q13342 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP140Q13342 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP140Q13342 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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