Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP2Q13309 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP2Q13309 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms